I sistemi CAPILLARYS sono basati sul principio dell'elettroforesi capillare in fase libera.

La separazione delle molecole cariche avviene in base alla loro mobilità elettroforetica in tampone alcalino ed è determinata dal pH dell'elettrolita e dal flusso elettroendosmotico.

Gli strumenti per elettroforesi capillare Sebia sono dotati di più capillari in parallelo che consentono l'esecuzione simultanea di analisi multiple:

• CAPILLARYS 3 TERA (12 capillari)
• CAPILLARYS 2 (8 capillari)
• MINICAP (2 capillari)

I capillari vengono riempiti con il tampone di separazione, mentre ciascun campione viene prima diluito in un apposito tampone di diluizione e poi iniettato per aspirazione all'estremità anodica dei capillari. L'alta tensione successivamente applicata consente la separazione delle diverse frazioni proteiche, che vengono rilevate e quantificate, direttamente a una lunghezza d'onda specifica, all'estremità catodica dei capillari.

Al termine dell'analisi i capillari vengono immediatamente lavati con la specifica  soluzione di lavaggio e nuovamente riempiti di tampone durante la preparazione dei campioni successivi.